Набор DEPArray FFPE SamplePrep Kit для пробоподготовки, Menarini Silicon Biosystems (Италия)
Набор DEPArray FFPE SamplePrep Kit специально разработан для очистки формалин-парафин фиксированных человеческих тканей и их иммунофлуоресцентной окраски антикератиновыми и антивиментиновыми антителами. Набор позволяет детектировать, идентифицировать и выделять виментин-положительные стромальные клетки и кератин-положительные раковые клетки на системах DEPArray (V2) и DEPArray NхT.
Анализ таких образцов на системах DEPArray позволяет выделять 100% чистых клеток из каждой популяции в клеточной суспензии.
Образцы:
Набор DEPArray FFPE SamplePrep Kit валидирован для формалин-парафин фиксированных человеческих тканей
- первичных кератин-положительных карцином легких, груди, кишечника, поджелудочной железы, простаты и яичников
- метастазированных кератин-положительных карцином в легких, груди, кишечнике, поджелудочной железе, простате и тканях яичников
Процедура:
Процедура очистки и окраски с помощью набора DEPArray FFPE SamplePrep Kit разделена на два основных этапа:
ЭТАП 1 - очистка и расщепление формалин-парафин фиксированных человеческих тканей до суспензии одиночных клеток;
ЭТАП 2 - иммунофлуоресцентная окраска стромальных клеток и эпителиальных раковых клеток в клеточной суспензии.
После окрашивания клеток необходимо проверить качество ДНК в клеточной суспензии с помощью контрольного набора FFPE QC Kit (обязательно при дальнейшем NGS-секвенировании или использовании в системах DEPArray). Идентификация и выделение различных клеточных популяций на системах DEPArray основаны на специфическом иммунофлуоресцентном окрашивании и измерении содержания ДНК.
Описание образцов:
- Формалин-парафин фиксированные образцы тканей кератин-положительной карциномы легких, груди, кишечника, поджелудочной железы, простаты и яичников
- Один образец толщиной -> 20, 30, 40 или 50 мкм
- Содержание раковых клеток в опухоли: от 5% до 95%
Оптимизация процесса:
Преимущества использования готового набора в сравнении с созданием собственного протокола:
Использование готового решения позволяет оптимизировать процесс, снизить трудозатраты и сэкономить большое количество времени при проведении исследований.