Секвенатор GenomeLab GeXP производства AB SCIEX (США)
Система генетического анализа, секвенатор нового поколения GenomeLab GeXP предназначена для выполнения различных задач, включая секвенирование ДНК и анализ фрагментов, на одной платформе. Принцип работы автоматического секвенатора GenomeLab GeXP основан на применении ОТ-ПЦР с высокой степенью мультиплексности, что позволяет быстро, эффективно и с высокой чувствительностью оценить экспрессию целого набора генов. Система генетического анализа GenomeLab GeXP использует более десятка передовых инженерных решений в области лабораторной автоматизации и капиллярного электрофореза.
Широкий спектр реализуемых на системе генетического анализа (секвенаторе) GenomeLab GeXP приложений позволяет подтверждать результаты исследований одного образца различными методами.
- Экспрессия генов
- Секвенирование
- Анализ SNP (олигонуклеотидные полиморфизмы)
- Анализ STR (короткие тандемные повторы)
- AFLP (полиморфизм длин амплифицированных фрагментов)
- MLPA (полиморфизм лигированных фрагментов)
Система генетического анализа (секвенатор) GenomeLab GeXP позволяет проводить количественные исследования в мультиплексном формате. Секвенатор GenomeLab GeXP воспроизводимо измеряет малые, но биологически значимые изменения экспрессии генов (0.5-кратные изменения). Проведение мультиплексных реакций даёт возможность исследовать в одной лунке несколько референсных генов, анализируемые гены и внутренний стандарт, обеспечивая повышение точности и достоверности результатов секвенирования.
Система генетического анализа (секвенатор) GenomeLab GeXP может работать с одним или двумя 96-луночными планшетами. Блок секвенатора GenomeLab GeXP, состоящий из восьми капилляров, позволяет с высокой эффективностью работать с 96-луночным форматом и даёт возможность проанализировать более чем 192 образца за 24 часа.
Система генетического анализа GenomeLab GeXP оснащена лазерами с большим сроком службы. В вертикальной части модуля детекции секвенатора регистрируется лазер-индуцированная флуоресценция. При этом выполняется автоматическая настройка положения капилляров для обеспечения высокочувствительной детекции образцов ДНК. Для возбуждения излучения инфракрасных красителей в секвенаторе GenomeLab GeXP используются диодные лазеры с длительным сроком службы. Такие лазеры более чувствительные, чем ионные аргоновые лазеры.
Встроенный в систему генетического анализа GenomeLab GeXP сканнер штрих-кода обеспечивает безошибочную идентификацию образцов. Сканер также позволяет объединить секвенатор GenomeLab GeXP с автоматизированными лабораторными станциями и автоматически вводить информацию об образцах в память системы.
Экспрессия генов
Анализ экспрессии генов используется для решения самых разных задач: разработка биомаркеров опухолей, определение «генетических подписей», анализ токсичности лекарственных препаратов, исследования стволовых клеток, геномика растений, валидация результатов, полученных на микрочипах, и т.д.
В системе генетического анализа (секвенаторе) GenomeLab GeXP используется упрощённая двухфазная мультиплексная ПЦР для амплификации сразу нескольких биомаркеров. Каждая мультиплексная реакция на секвенаторе GenomeLab GeXP проводится в присутствии референсных генов и внутреннего стандарта в каждой лунке. Такой подход позволяет снизить расход реагентов, устранить погрешности пипетирования и позволяет практически избежать проведения повторных реакций. Программный модуль секвенатора eXpress Designer позволяет легко создавать специфические панели для определённых генетических исследований.
- Высокопроизводительный количественный анализ экспрессии генов
Масштабируемая система генетического анализа GenomeLab GeXP анализирует до 30 генов в одной реакции и позволяет получать до 5 760 точек данных за 24 часа в полностью автономном режиме.
- Рентабельный и быстрый анализ
Мультиплексные возможности секвенатора GenomeLab GeXP позволяют снизить стоимость ПЦР и увеличить её эффективность. Анализ до 30 генов в одном образце существенно уменьшает затраты и время исследования в пересчёте на один ген.
- Высокая точность и воспроизводимость
Система генетического анализа (секвенатор) GenomeLab GeXP обеспечивает непревзойдённую линейность измерений (для большинства генов средний коэффициент R2 > 0.99), что позволяет получать точный профиль экспрессии генов и обнаруживать 0.5-кратное изменение экспрессии. Высокое соотношение «сигнал – шум» повышает чувствительность и воспроизводимость секвенирования.
- Небольшой объём образца
Мультиплексные возможности системы генетического анализа GenomeLab GeXP и технология капиллярного электрофореза позволяют эффективно исследовать набор генов, используя всего 5-50 нг РНК
- Совершенное программное обеспечение
Программное обеспечение для системы генетического анализа GenomeLab GeXP контролирует все этапы высокопроизводительного анализа экспрессии генов: от подбора праймеров до управления исследованиями. Программное обеспечение GenomeLab eXpress Profiler позволяет легко разработать план анализа, включая быстрый автоматизированный подбор праймеров, построение схемы мультиплексной реакции и вычисление относительных значений экспрессии генов. Модуль eXpress Analysis идентифицирует информацию о фрагментах и объединяется с файлом исходных данных. Данные модуля eXpress Analysis можно импортировать в модуль eXpress Map для визуализации в виде изображения матрицы высокой плотности («тепловой» карты).
Секвенирование
Для секвенирования ДНК в системе генетического анализа GenomeLab GeXP используется линейный полиакриламидный гель, капилляры со специальным покрытием, соединения на основе дезоксиинозинтрифосфата и красители, излучающие в ближнем инфракрасном свете. Денатурация образца выполняется в системе генетического анализа автоматически. Использование секвенатора GenomeLab GeXP и наборов реагентов AB Sciex обеспечивает высокую чувствительность при определении меченых красителями продуктов реакции секвенирования, даёт возможность получать надёжный сигнал от секвенатора и контролировать условия электрофоретического разделения. Секвенатор осуществляет мультиплексный анализ фрагментов, анализ SNP, STR, AFLP и MLPA.
Преимущества системы генетического анализа GenomeLab GeXP
- Один тип капилляров и один гель для проведения разных типов генетических исследований
- Автоматическая денатурация и автоматическое внесение образца
- Автоматическая замена геля
- Одновременный анализ восьми образцов
- Возможность анализа 192 образцов (два планшета) за сутки без вмешательства оператора
- Высокая точность и производительность: 700 пар оснований определяются менее чем за 100 минут, включая время предстартовой подготовки секвенатора, с точностью 98%
- Мультиплексный количественный анализ экспрессии генов: до 30 генов в одной реакции
- Интегрированное устройство для считывания штрих-кода (модификация с двумя планшетами)
- Программное обеспечение представляет собой комплексный пакет, включающий все программы для определения нуклеотидной последовательности, фрагментного анализа и количественной экспрессии генов
- Готовые наборы реагентов
Технические характеристики секвенатора GenomeLab GeXP
GenomeLab GeXP |
С двумя микропланшетами |
С одним микропланшетом |
Кат. № |
А26572 |
А62684 |
Капилляры |
Изолированный блок из 8 капилляров со специальным внутренним покрытием |
|
Гель |
Линейный полиакриламидный гель, поставляется в шприцах |
|
Формат планшетов для образца/буфера |
96-луночные микропланшеты |
|
Источники света |
2 диодных лазера первого класса опасности |
|
Детекция |
Флуоресценция на четырёх длинах волн |
|
Операционная система |
Win XP |
|
Система управления |
Два ПК с мониторами |
|
Габариты (ШхГхВ) |
61х66х94 см |
|
Вес |
81.6 кг |
|
Электроподключение |
11-240 В, 5 А, 50/60 Гц |
|
Отзывы
Оставьте первый отзыв
Добавить отзыв
Добавить отзыв