В НАЛИЧИЕ НА СКЛАДЕ КАТАЛОГ


Таргетные генетические анализы на базе генетического анализатора MassARRAY производства Agena Bioscience (США)


Проведение таргетных генетических анализов с помощью генетического анализатора MALDI-TOF имеет ряд преимуществ, важных для практического использования.

Рациональность

Проведение таргетного анализа по транслокациям для соматических вариантов в пределах одного рабочего процесса.

Практичность

Оптимизация времени и ресурсной базы, получение мутационного профиля с помощью мультиплексного анализа.

Гибкость

Для анализа требуется небольшое количество ДНК, извлечённое из любого образца, в том числе из парафин-формалин фиксированных тканей.

Обзор метода

Доказано, что соматические мутации в таких генах, как EGFR, KRAS и BRAF, влияют на прогрессирование онкологического заболевания и эффективность медикаментозной терапии. В связи с тем, что количество обнаруживаемых мутаций, связанных с развитием заболеваний, увеличивается, у лабораторий возникает потребность в платформе, которая сочетала бы в себе высокую чувствительность, гибкость и экономическую эффективность. Система MassARRAY - это таргетное решение, позволяющее быстро анализировать от десятков до сотен мутаций в образцах различных типов

Преимущества системы MASSARRAY

  • Выполняет анализы из нативных, замороженных или фиксированных формалином и залитых парафином (FFPE) образцов тканей
  • В одном рабочем прогоне одновременно анализируются сотни мутаций при объёме образца всего лишь 10 нг ДНК
  • Идентификация мутаций с частотой встречаемости менее чем 0.1%
  • Разработка специальных пользовательских панелей по ортогональным мутациям, такие мутации не способны анализировать системы NGS

Приложения для клинических исследований

Система генетического анализа MassARRAY является мощным инструментом для клинических исследований и для проведения таргетного высокочувствительного анализа в области персонализированной медицины.

Ортогональное подтверждение

Подтверждение данных NGS с помощью панелей OncoCarta и панели по раку легких LungCarta

Таргетный анализ1

Анализ клинически значимых мутаций с помощью таргетных панелей по ключевым онкогенам.
Готовые решения: панель OncoFOCUS, панель LungFUSION

Жидкостная биопсия2

Нахождение мутаций с частотой встречаемости менее 0.1% как в циркулирующих опухолевых клетках, так и в плазме крови (деградированная ДНК)
Готовое решение: реагенты панели UltraSEEK

1 Assays by Agena OncoFOCUS Panel v3 Application Note.

2 Michael J. Mosko et al. “Ultrasensitive Detection of Multiplexed Somatic Mutations Using MALDI-TOF Mass Spectrometry”, The Journal of Molecular Diagnostics 18.1 (2016): 23-31.

Высокочувствительное определение мутаций

Компания Agena Bioscience предлагает целый набор методик и готовых решений, созданных для быстрого профилирования соматических мутаций, инсерций, делеций и транслокаций. С помощью регентов iPLEX определяются аллели с частотой встречаемости менее 5% при объёме образца 10 нг ДНК для одной мультиплексной лунки. Весь цикл генетического анализа на системе MassARRAY, от получения очищенной ДНК до получения отчёта, занимает рабочий день.

Редкие мутантные аллели, присутствующие как в ЦОК, так и деградированной ДНК, выделенной из плазмы крови, являются носителями ключевой информации для раннего обнаружения злокачественных новообразований, отслеживания роста опухоли и мониторинга динамики заболевания. Специально разработанные наборы UltraSEEK являются мощным и сверхчувствительным инструментом, который позволяет обнаруживать редкие генетические события с чувствительностью менее 0.1% в мультиплексном формате. Для оптимизации результатов одновременно мультиплексируются более 10 анализов.

От образца ДНК до получения результатов: простота и доступность

Для удобства пользователя в системе используются интерактивный формат, основанный на HTML-протоколе. Получаемая информация о кластерных участках предоставляет быструю визуализацию по генам, осуществляет контроль качества данных и позволяет классифицировать мутации.

Рисунок 1. Пример отчета системы MassARRAY

Отчет по конкретному образцу с использованием протокола HTML, показан мутационный статус (панель OncoFOCUS).

Известные зарекомендовавшие себя на практике решения для генетического анализа

Система генетического анализа MassARRAY универсальна, она совместима с множеством других приложений для онкогенетики. Для быстрого поиска искомых точек интереса исследователю достаточно взять за основу предварительно валидированную панель, содержащую ключевые онкогены.

Предварительно разработанные панели

Ресурсы для дизайна и анализа

Совместные исследования с Agena Bioscience

OncoFOCUS

GyneCarta

ColoCarta

LungCarta

LungFUSION

MelaCarta

OncoCarta

  • Дизайн эксперимента онлайн
  • Заказ праймеров
  • Проведение экспериментов с реагентами iPLEX или UltraSEEK
  • Разработка пользовательских панелей при поддержке учёных компании Agena Bioscience
  • Выполнение индивидуальных заказов на исследования

Получение результатов

1-2 дня

5-6 недель

Если необходимая панель для исследования/анализа ещё не разработана, можно воспользоваться гибкостью системы MassARRAY, которая адаптируется под конкретные задачи пользователя. Доступ на онлайн ресурс по дизайну экспериментов позволяет находить искомую последовательность и точки интереса, в автоматическом режиме подбирать под них праймеры с отчетами по олигонуклеотидам, создавать и оптимизировать мультиплексы. Также можно воспользоваться помощью специалистов компании, которые помогут разработать панели любой специфики.

Валидация научным сообществом

Более 2 500 научных публикаций подтверждают надёжность и практическую пользу системы MassARRAY. Примеры успешных исследований включают в себя:

  • Колоректальную аденокарциному
  • Рак легких
  • Рак яичников, матки и молочных желез
  • Меланому
  • Гемобластоз
  • Рак ЖКТ
  • Рак предстательной железы
  • Исследования жидкостных биопсий

Библиотека работ, чьи результаты получены с помощью генетического анализатора MassARRAY, всё время пополняется. Обратитесь в компанию БиоГен-Аналитика по электронной почте 84997046244@bga.su, чтобы подписаться на рассылку обновлений.



Связаться с нами / оформить заказ

Ваше имя *
Организация *
Контактный телефон
Контактный E-mail *
Интересующий продукт *
Сообщение
пожалуйста, заполните все поля со *

CAPTCHA Подтвердите, пожалуйста, что Вы человек:

При отправке заявки вы соглашаетесь на использование ваших персональных данных